Глобальные новости: Прямые ПЦР-тесты клубней на вирус PVY заменяют зимнее выращивание, швейцарская лаборатория одобрила 1,000 партий семян за шесть недель.
В Швейцарии проводят тестирование спящих клубней на вирус PVY методом ОТ-ПЦР, а в Айдахо разрабатывают аналогичный подход для замены зимнего выращивания в Гавайях. Результаты становятся известны на несколько месяцев раньше, но неравномерное распределение вируса в клубнях ограничивает согласованность с более старыми методами тестирования.
Для сертификации семенного картофеля после сбора урожая необходима окончательная проверка на вирусы. На протяжении десятилетий это был «выращивание»: образец клубней высаживали в теплое место на зиму, а листья проверяли на наличие вируса картофеля Y (PVY) и вируса скручивания листьев картофеля (PLRV). В настоящее время лаборатории в Европе и США проводят прямое тестирование спящих клубней методом ОТ-ПЦР.
Швейцария уже внесла эти изменения. Статья 2021 года в журнале Potato Research.Оливье Шумп и его коллеги из компании Agroscope описывают тестирование от 900 до 1,000 партий семян и более 180 000 клубней ежегодно методом ОТ-ПЦР. Лаборатория может обработать 1,000 партий за шесть недель, имея в штате от шести до восьми сотрудников. Старый метод требовал от 4 до 8 недель только для того, чтобы вывести клубни из состояния покоя с помощью токсичных химикатов, прежде чем растения могли начать расти.
Результаты были близки к результатам старого теста, но не идентичны. При сравнении с ИФА 30 партий (64%) дали сопоставимые результаты. В 17 партиях (36%) наблюдались небольшие различия. Авторы связывают это с биологическими особенностями, а не с самим тестом: вирус распространяется неравномерно внутри клубней, особенно у сортов, устойчивых к инфекции.
В будние дни. Отписаться можно одним щелчком мыши.
В Соединенных Штатах Ассоциация по улучшению сельскохозяйственных культур штата Айдахо (ICIA) по-прежнему проводит озимую программу выращивания сельскохозяйственных культур на Гавайях. Согласно одному из источников, отчет в Potato BusinessВ лаборатории ежегодно тестируется до 900 партий семян, по 400 клубней в каждой, с использованием ИФА для выявления вирусов PVY и PLRV. С лета 2022 года исследовательница из Университета Айдахо Лиза Тран под руководством вирусолога Александра Карасева работает над тестированием спящих клубней методом ПЦР в лаборатории ICIA в Айдахо-Фолс. В отчете говорится, что результаты ПЦР для PVY и PLRV сопоставимы с результатами, полученными при выращивании. Фермеры смогут получить результаты на несколько месяцев раньше. Работа финансируется за счет гранта USDA Specialty Crop Block Grant в размере 130 000 долларов и гранта USDA-NIFA-SCRI в размере 5.8 миллионов долларов. Главная проблема — масштаб: лаборатории необходимо обрабатывать 400 клубней в каждой партии вместо 400 листьев.
Во многих местах правила по-прежнему требуют применения старого подхода. В Монтане, правила сертификации По словам экспертов, для продажи всех семян необходимо проводить послеуборочное тестирование на зимнем опытном участке. Семена второго поколения могут содержать до 1% вируса PVY в летних испытаниях, а семена, повторно высаженные в Монтане, не должны превышать 0.5%.
Почему это важно
Результаты анализа на вирусы при выращивании рассады становятся известны в конце зимы, часто всего за несколько недель до отправки семян. Прямой анализ клубней позволяет выявить вирус до начала сезона продаж. Таким образом, покупатели могут заранее выбрать партии с известным уровнем вирусной нагрузки, а производители семян могут установить цены и спланировать свои продажи.
Швейцарские данные также указывают на ограничения. Поскольку вирус неравномерно распределен в клубнях, количество клубней и способ их объединения определяют надежность результатов анализа партии. Покупателям семян следует спрашивать, какой метод использовался, а не только уровень вируса.
Фото: Устройство для ПЦР в реальном времени в лаборатории (иллюстративный пример). Информатика / Викимедиа Коммонс, CC BY-SA 3.0
