Бактериальные болезни растений

Резюме

BBSRC от имени Министерства окружающей среды, продовольствия и сельского хозяйства (Defra), Совета по исследованиям природной среды (NERC) и правительства Шотландии объявляет о призыве к проведению исследований для устранения угроз здоровью растений и биобезопасности Великобритании, вызванных бактериальными заболеваниями. Принимаются предложения для мультидисциплинарных и междисциплинарных исследований бактериальных патогенов растений и их взаимодействия с растениями-хозяевами, беспозвоночными vectorи более широкой окружающей среды.

Этот призыв является второй фазой более широкой программы по бактериальным болезням растений, поддерживаемой Фондом стратегических приоритетов Великобритании по исследованиям и инновациям (UKRI). Он дополнит работу недавно созданного консорциума BRIGIT, ориентированного на Xylella fastidiosa за счет финансирования исследований различных заболеваний.

Предыстория

Растет обеспокоенность по поводу потенциальных и существующих угроз здоровью растений (включая деревья) и биобезопасности Великобритании из-за более широкого распространения и более частого возникновения как новых, так и местных бактериальных заболеваний. Факторы, способствующие этому, включают изменение окружающей среды и увеличение оборота потенциально загрязненных растений или растительных материалов в торговле. Эти патогены (и их беспозвоночные vectors) угрожают растениеводству, лесному хозяйству, коммерческому и садоводству, а также лесным массивам и более широкому биоразнообразию в более широкой окружающей среде. Они потенциально могут вызвать масштабные и серьезные экономические, экологические и социальные последствия для ландшафтов и экосистем, как сельских, так и городских.

Бактериальные фитопатогены разнообразны и вызывают многие виды заболеваний. Их передача может происходить воздушно-капельным, почвенным или через беспозвоночных. vectorс. При завозе в новые районы их распространение непредсказуемо, но зачастую весьма инвазионно. С ними трудно бороться с помощью химикатов, и, в отличие от многих других патогенов растений, они часто имеют большое количество потенциальных хозяев.

Обеспокоенность усиливается относительной нехваткой исследований бактериальных фитопатогенов, усугубляемой наличием ограниченного научного потенциала и возможностей для решения тех проблем, которые они создают. Патогены часто трудно изучать: инфекция может быть скрытой и бессимптомной, в то время как некоторые патогены «не культивируются» за пределами растений-хозяев.

Реестр рисков для здоровья растений Defra содержит информацию о многих бактериальных патогенах, и все больше патогенов добавляются по мере того, как они становятся опасными. Этот призыв не касается исключительно тех бактериальных заболеваний, которые включены в регистр, но заявители могут найти в нем полезный источник информации.

Цель

Целью этого конкурса заявок является поддержка междисциплинарных и междисциплинарных исследований для понимания и информирования об управлении угрозами здоровью растений в Великобритании от бактериальных заболеваний с потенциально серьезным воздействием на культурные растения или окружающую среду. Он направлен на удовлетворение потребностей политиков и практиков, используя научные возможности для устранения пробелов в знаниях биологии и эпидемиологии этих болезней, чтобы оптимизировать ответные меры для борьбы с ними.

Конкурс также направлен на расширение возможностей и потенциала исследований бактериальных заболеваний путем объединения опыта в области патологии растений с новейшими геномными и другими технологиями, а также исследованиями в других дисциплинах. Там, где это возможно, это исследование должно опираться на соответствующие подходы из других областей, особенно в более широком контексте окружающей среды, чтобы понять взаимодействие между патогенами, их хозяевами и vectorи более широкие экосистемы.

Портфель финансируемых проектов будет активно управляться для содействия обмену знаниями - между проектами и с заинтересованными сторонами, чтобы использовать возможности для синергии и обеспечить соответствие потребностям пользователей.

Объем

Этот призыв является второй фазой более широкой программы по бактериальным болезням растений, поддерживаемой SPF, с дополнительными взносами от Defra и правительства Шотландии. Он охватывает все типы бактериальных патогенов (включая фитоплазмы), которые поражают или угрожают культурным или другим (наземным или водным) растениям (включая деревья), имеющим коммерческое, экологическое, социальное или культурное значение и ценность в Великобритании.

Чтобы понять биологию бактериальных патогенов и их сложное взаимодействие с растениями-хозяевами, беспозвоночные vectorКак и в более широком контексте, предложения должны будут опираться на опыт различных исследовательских дисциплин. Они могут включать бактериологию, экологию, энтомологию, эпидемиологию, геномику, моделирование, патологию растений, социальные науки и любые другие соответствующие области исследований. Особенно приветствуются инновационные междисциплинарные подходы, объединяющие различные виды экспертных знаний.

Финансируемое исследование должно быть не только превосходным с научной точки зрения, но и стратегически соответствующим потребностям потенциальных пользователей: правительства, государственных органов, бизнеса, промышленности и неправительственных организаций. Ожидается, что заинтересованные стороны будут вовлечены в разработку и реализацию проектов, чтобы обеспечить их соответствие политике и практике.

Кроме того, предложения должны продемонстрировать, как они могут увеличить потенциал и возможности Великобритании в области исследований бактериальных болезней растений.

Предложения приглашаются для проектов по решению проблем по одной или нескольким из следующих тем, но они не предназначены для того, чтобы быть предписывающими или исключительными:

Последствия изменения окружающей среды

Изменения в окружающей среде и управлении ею, вероятно, приведут к изменениям в способах распространения бактериальных патогенов и воздействии на их хозяев. Изменения температуры, характера осадков, CO₂ концентрации, насекомое vector поведение, землепользование и поведение в сельском хозяйстве — все это может повлиять на то, как хозяин подвергается воздействию возбудителя, а также на то, заразится ли бактериальное заболевание после первого прибытия в Великобританию. Приложения для изучения влияния изменения окружающей среды на бактериальные заболевания помогут заинтересованным сторонам понять бактериальные заболевания и подготовиться к ним сейчас и в будущем.

Передача между хозяевами

Одной из самых серьезных проблем, связанных с некоторыми бактериальными заболеваниями, является их склонность поражать особенно широкий круг растений-хозяев. Понимание не только круга хозяев патогена, но и того, как он способен влиять на новых хозяев, может дать нам знания, которые можно использовать для предотвращения заражения дальнейших хозяев. Понимание роли vectorПроблемы, связанные с передачей болезней и заражением растений, также будут иметь ключевое значение для разработки способов снижения воздействия этих болезней.

Факторы, влияющие на патогенность

Чтобы бактериальное заболевание закрепилось на растении-хозяине, бактерия должна встретиться с хозяином в такой форме, в которой может иметь место заражение. Приветствуются заявки, чтобы понять жизненный цикл патогена и причины, по которым он является патогенным, а также понять, как возникает эта патогенность. Это может сыграть роль в информировании заинтересованных сторон о рисках заражения, в том числе от импортированного растительного материала.

Влияние почвы / почвенного микробиома

Почва может играть разнообразную роль в передаче и распространении бактериальных болезней растений. Патогенные бактерии могут жить в почве и заражать растения-хозяева, которые там растут, и, в отличие от патогенов, поражающих верхние части растений, почвенные бактерии трудно лечить. Кроме того, болезни могут распространяться через живущие в почве организмы, такие как нематоды и слизни. Почвенные условия, в том числе почвенный микробиом, также могут иметь влияние, но в этой области было проведено мало исследований, и приложения для изучения роли почвы в бактериальных заболеваниях растений приветствуются.

Понимание устойчивости и восприимчивости хозяина

Механизмы, с помощью которых растения-хозяева противостоят атакам бактериальных патогенов, были изучены, но не всегда ясно, почему один вид хозяина будет восприимчив к бактериальному заболеванию, а другой вид будет в значительной степени устойчивым. Понимание резистентности хозяев входит в сферу этого призыва, но заявки, направленные в первую очередь на селекцию устойчивых сортов сельскохозяйственных культур, будут отклонены.

Финансируемое исследование должно входить в сферу компетенции BBSRC и / или NERC и включать существенный элемент исследовательской биологии и / или науки об окружающей среде. Но чтобы обеспечить их актуальность для заинтересованных сторон и потенциал воздействия, предложения должны учитывать экономический и социальный контекст проблем здоровья растений, которые они стремятся решить. При условии, что они тесно интегрированы с другими аспектами предлагаемой работы, проекты могут также включать соответствующие элементы экономического анализа или социальных наук.

Первая фаза программы SPF по бактериальным болезням растений представляет собой комплексную междисциплинарную работу в размере 5 миллионов фунтов стерлингов. Xylella fastidiosa консорциумом учреждений BRIGIT во главе с Центром Джона Иннеса. Хотя дополнительные исследования по X. раздражает не исключена из настоящего конкурса, предлагаемая работа должна отличаться от BRIGIT и других существующих исследований и дополнять их, включая проекты XF-ACTORS и POnTE, поддерживаемые программой Horizon 2020 Европейского Союза. Предложения должны демонстрировать добавленную стоимость, которую они могут обеспечить за счет синергии с текущей деятельностью.

Ожидается, что предложения по исследованию роли бактерий в болезнях дуба будут соответствовать приоритетам партнерства Action Oak и взаимодействовать с ним. Defra предложила предоставить письмо поддержки предложений, направленных на достижение целей Action Oak, пожалуйста, свяжитесь с Сарой Джеффри по адресу info@actionoak.org с описанием вашего предложения для получения дополнительной информации. 

Из конкурса не принимаются исследования по следующим темам:

• исследования бактериального загрязнения / гниения сельскохозяйственных культур после сбора урожая
• исследования с конкретной целью создания условий для коммерческого разведения растений, устойчивых к определенным бактериальным патогенам
• исследования для понимания взаимодействия между растениями и бактериальными патогенами человека и их роли в передаче болезней людям.

Масштаб и продолжительность проекта

Доступно до 13 миллионов фунтов стерлингов, в зависимости от качества полученных предложений, с целью поддержки должным образом широкого и сбалансированного портфеля, включающего до 20 проектов. Заявки не должны превышать 2.5 миллиона фунтов стерлингов (при 100% их полной экономической стоимости). Спонсоры стремятся финансировать портфель проектов разного масштаба и направлений. Приветствуются крупномасштабные междисциплинарные заявки, но не исключаются и более мелкие, более целевые проекты.

Средства могут быть запрошены на срок до трех лет, и ожидается, что проекты начнутся к 1 мая 2020 года.

Все проекты будут финансироваться из расчета 80% их полной экономической стоимости.

Городская встреча

21 июня было проведено городское собрание, чтобы предоставить потенциальным заявителям и заинтересованным сторонам возможность узнать больше об истории конкурса и понять, что спонсоры надеются поддержать через него. С презентациями выступили Джон Найт, Никола Спенс, Саския Хогенхаут и Дебби Хардинг, и они доступны в разделе «Загрузки». 

Приемлемость

Приглашение открыто для лиц, имеющих право на участие в организациях, которые обычно имеют право подавать заявки на исследовательские гранты от исследовательских советов UKRI. Применяются стандартные критерии соответствия BBSRC и NERC, см. Загрузки и НКРЭ: Право на получение исследовательского гранта.

Только для этого звонка: Право подавать заявки имеют научно-исследовательские учреждения государственного сектора (PSRE) с 10 или более исследователями с докторской степенью (или эквивалентными). Если PSRE, желающие подать заявку, ранее не подавали заявку на финансирование UKRI и в настоящее время не имеют статуса IRO, они должны будут заполнить форму соответствия (см.: UK Research and Innovation: Заявка на право подать заявку на финансирование исследований в UK Research and Innovation) для обеспечения необходимого исследовательского потенциала, систем и средств контроля для управления исследованиями и грантового финансирования. Соискателям PSRE следует связаться с plant.bacteria@bbsrc.ukri.org при первой возможности обсудить свои интересы в подаче заявки.

Заявки, в которых указаны основные или соисследователи, которые не имеют права подавать заявку на финансирование, и / или неподходящие организации, будут отклонены.

Зарубежные исследовательские институты могут быть совместными партнерами в проектах, но не имеют права на получение прямого финансирования в рамках инициативы. Заявки на исследовательские гранты не будут приниматься от зарубежных организаций или от соискателей из Великобритании, если предложения содержат запросы на прямое финансирование зарубежных соискателей (но см. Раздел о субподряде ниже).

Организации частного сектора, благотворительные организации и НПО, не имеющие статуса IRO, утвержденного UKRI, могут участвовать в качестве партнеров по сотрудничеству, но такие организации не имеют права подавать заявки или получать прямое финансирование от этой инициативы (но см. Раздел о субподряде ниже).

Во всех случаях совместной деятельности с организациями, отличными от перечисленных выше классов приемлемых учреждений, как заявители, так и соавторы / партнеры по проекту должны знать, что любые расходы, понесенные, прямые или иным образом, либо сотрудниками, либо учреждениями-сотрудниками (партнерами по проекту) в связи с этим. с сотрудничеством, эта инициатива не может быть реализована.

Дальнейшие инструкции по привлечению соавторов и партнеров проекта доступны в руководстве по грантам BBSRC (см. Раздел загрузок).

Аспекты субподряда предлагаемой работы с учреждениями, не имеющими права напрямую подавать заявку на финансирование, например, из-за отсутствия соответствующего опыта в соответствующих учреждениях, являются приемлемыми. Однако кандидатам необходимо будет продемонстрировать, что участие любого субподрядчика предоставит доступ к основным возможностям, которые не всегда доступны в соответствующей исследовательской организации Великобритании. Подробная информация о субподряде находится в Руководстве по грантам BBSRC.

Расписание

Предварительное объявление о звонке	4 марта 2019
Запуск звонка	20 мая 2019
Городская встреча	21 июня 2019
Срок подачи заявок	25 июля 2019
Оценочная встреча	Декабрь 2019 (подлежит уточнению)
Выдано исследовательских грантов	Февраль 2020 (подлежит уточнению)

Существуют ограничения на продолжительность этой программы финансирования, и все гранты должны начаться не позднее 1 мая 2020 года.

Процесс подачи заявки и оценки

Заявки на исследовательские гранты должны подаваться через систему совместной электронной подачи исследовательских советов (Je-S), и их оценка будет проводиться BBSRC. Потенциальным кандидатам следует иметь в виду, что подходящие лица и организации должны быть зарегистрированы в системе Je-S, чтобы иметь возможность подавать заявки. Любое подходящее учреждение или физическое лицо, рассматривающее возможность подачи предложения, но в настоящее время не зарегистрированное для использования системы, должно рассмотреть возможность ранней регистрации и связаться со службой поддержки Je-S (jeshelp@je-s.ukri.org ; 01793 444164).

Кандидаты должны войти в Je-S и выбрать:

• Совет: BBSRC
• Тип документа: стандартное предложение
• Схема: Стандарт
• Звоните / Тип / Режим: Программа по борьбе с бактериальными болезнями растений, фаза 2

Для этого звонка потребуется дополнительный документ «План взаимодействия с заинтересованными сторонами». Пожалуйста, загрузите это в свое приложение как тип вложения «Другое вложение» в Je-S. Все остальные документы требуются в соответствии со стандартными заявками, однако для этого звонка ограничение на количество страниц для Обращения за поддержкой и Досье истории должно составлять максимум двенадцать сторон формата А4 (включая две страницы послужного списка и десять страниц Обращения к Служба поддержки).

Заявки должны быть поданы до 16:00 BST в день окончания срока подачи заявок. Продление сроков не принимается. Мы рекомендуем вам подавать заявки заблаговременно до крайнего срока подачи заявок.

Критерии оценки предложений будут следующими:

• Научное превосходство
• Соответствие объему и цели звонка
• Экономическое и социальное воздействие
• Актуальность стратегии и политики
• Цена денег
• Потенциал для наращивания потенциала и потенциала
• Взаимодействие с заинтересованными сторонами
• Надежность и целесообразность плана управления проектом, в частности, для управления междисциплинарными консорциумами.

Финансирующие организации примут окончательное решение по проектам, которые будут финансироваться, на основе рекомендаций оценочной комиссии. Спонсоры также учтут общий охват и сбалансированность финансируемой программы работы.

Пути к воздействию

Кандидаты должны будут заполнить заявление «Пути воздействия» в рамках своей заявки; это стандартное требование к заявкам на гранты Исследовательского совета, которые рассматриваются как часть процесса экспертной оценки. Партнеры по финансированию заинтересованы в том, чтобы исследователи, финансируемые в рамках этой программы, планировали программу взаимодействия с заинтересованными сторонами и обмена знаниями, которая будет осуществляться на протяжении всего срока их проекта. Кандидатам следует тщательно продумать, как знания и опыт, полученные в ходе проекта, будут доступны для соответствующих политиков и других заинтересованных сторон. Следует также включить любые другие виды воздействия, которые могут возникнуть в результате исследования. Посмотри пожалуйста Британские исследования и инновации: пути к успеху.

Кандидатам следует иметь в виду, что затраты, связанные с реализацией мероприятий по влиянию на конкретные проекты, могут быть включены в заявки на гранты. Затраты должны быть полностью оправданы. Спонсоры особенно заинтересованы в мероприятиях по оказанию воздействия, которые продлятся дольше срока действия гранта на исследования.

Взаимодействие с заинтересованными сторонами

В дополнение к документу «Пути к воздействию» от кандидатов потребуется предоставить план взаимодействия с заинтересованными сторонами. Спонсоры заинтересованы в активном участии соответствующих групп заинтересованных сторон в проектах, начиная с разработки проектов и заканчивая проведением исследования, а также заинтересованными сторонами, которые в конечном итоге используют результаты исследования. План взаимодействия с заинтересованными сторонами должен указывать, какие заинтересованные стороны собираются / могут быть вовлечены, как они будут вовлечены в проект и как их текущие потребности будут отражены в реализации проекта.

План взаимодействия с заинтересованными сторонами будет отдельным приложением к документу «Пути достижения воздействия» и будет иметь длину до двух страниц.

Джон Найт из AHDB предложили выступить в качестве посредника для содействия сотрудничеству между заявителями и соответствующими заинтересованными сторонами в отрасли; пожалуйста, свяжитесь с нами. Джон.Найт@ahdb.org.uk для дополнительной информации. 

Требования к финансированию и отчетности

Финансирование, предоставленное в рамках инициативы, будет осуществляться BBSRC. Он будет регулироваться стандартными условиями UKRI для исследовательских грантов (см. Загрузки), а также конкретными дополнительными или альтернативными требованиями, согласованными совместно BBSRC и его партнерами по финансированию (например, в отношении интеллектуальной собственности, управления данными и обмена, требований к отчетности, участия общественности или взаимодействие с финансирующим партнерством).

Проекты, поддерживаемые в рамках этой инициативы, будут длиться до трех лет.

В соответствии с обычной практикой исследовательских советов, проекты будут финансироваться из расчета 80% от приемлемых полных экономических затрат (FEC).

Спонсоры приняли политику UKRI в отношении открытого доступа к результатам исследований (см .: Исследования и инновации Великобритании: политика открытого доступа), и гранты будут финансироваться на этих условиях. Затраты на публикацию больше не являются приемлемыми расходами на гранты исследовательского совета.

Применяются стандартные требования к отчетности по исследовательским грантам, предоставленным в соответствии с условиями грантов UKRI.

Заявки будут доступны всем спонсорам; информация о финансируемых грантах будет доступна на сайтах спонсоров.

Контакты

Дебби Хардинг

plant.bacteria@bbsrc.ukri.org