Синхитриум эндобиотиум вызывает болезнь картофельных бородавок. Синхитриум эндобиотиум Облигатный паразит, образующий не гифы, а спорангии, содержащие подвижные зооспоры. Летние спорангии тонкостенные и недолговечные. Они образуются в тканях картофеля и дают начало новым зооспоровым инфекциям. Покоящиеся споры (иногда называемые также зимними спорангиями, зимними спорами, покоящимися сорусами или зимними сорусами) имеют толстостенные стенки и сохраняют жизнеспособность в течение чрезвычайно длительных периодов времени даже в отсутствие хозяина. Их можно производить в течение всего вегетационного периода. Они выделяются из разлагающихся бородавок в почву. Диагностика S. эндобиотика касается как растения, на котором могли образоваться бородавки, так и почвы, на которой могут образоваться бородавки.
переносят покоящиеся споры.
Многочисленные патотипы (расы) были описаны в С. эндобиотик . Они определяются их вирулентностью для дифференциальных сортов картофеля. Патотип 1(D1) в настоящее время редко заражает картофель в Европе, поскольку немногие сорта картофеля восприимчивы к нему, по-видимому, из-за наличия доминантной устойчивости у хозяина. Сообщается, что другие патотипы чаще встречаются в Западной Европе и особенно встречаются в дождливых горных районах Центральной и Восточной Европы. Они также встречаются за пределами Европы (например, в Ньюфаундленде, Канаде и в азиатской части Турции). Устойчивость к этим патотипам встречается редко, поэтому контроль сложнее. Патотипы, отличные от 1 (D1), различаются по дифференциальной вирулентности по отношению к конкретным сортам картофеля, но в остальном кажутся более тесно связанными друг с другом, чем с патотипом 1 (D1). Внутренние меры, рекомендованные в странах ЕОКЗР, требуют идентификации патотипов.
Идентичность летних спорангиев или покоящихся спор, наблюдаемых под микроскопом, можно подтвердить с помощью обычной ПЦР.
и ПЦР в реальном времени. Обычная ПЦР основана на внутреннем транскрибируемом спейсере области рибосомальной ДНК (ITS), при этом прямой праймер отжигается до ITS1, а обратный праймер отжигается до ITS2. ПЦР в реальном времени van Gent-Pelzer et al. (2010) основано на ITS2. ПЦР в реальном времени Smith et al. (2014), описанное здесь, основано на малых субъединицах (SSU) рибосомальных
ДНК (18S рДНК). ПЦР в реальном времени, разработанная Bonants et al. (2015) основано на однонуклеотидном полиморфизме (SNP), ассоциированном с патотипом 1(D1), выявленном с помощью анализа снижения сложности полиморфных последовательностей (CRoPS). При использовании материала картофельных бородавок для контроля эффективности выделения ДНК используется внутренний положительный контроль выделения, нацеленный на ген ЦОГ растения. Патотип 1 (D1) можно отличить по крайней мере от патотипов 2 (G1), 6 (O1) и 18 (T1) с помощью ПЦР в реальном времени.
Ссылка: ПМ 7/28 (2) Синхитриум эндобиотиум. Бюллетень ЕОКЗР, 47: 420–440. https://doi.org/10.1111/epp.12441
